11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5147 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013747  Htur_5147  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  850    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3790  integrase family protein  48.33 
 
 
408 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3518  phage integrase  40.76 
 
 
414 aa  279  7e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3025  hypothetical protein  41.23 
 
 
430 aa  273  4.0000000000000004e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3340  hypothetical protein  38.12 
 
 
473 aa  245  9e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2829  hypothetical protein  36.64 
 
 
435 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2801  hypothetical protein  27.29 
 
 
452 aa  90.1  7e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  24.01 
 
 
295 aa  49.7  0.00009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  25.56 
 
 
312 aa  46.2  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  25.56 
 
 
395 aa  45.8  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 
298 aa  43.5  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>