13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_06880 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_06880  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  234  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2642  hypothetical protein  37.5 
 
 
137 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2519  hypothetical protein  34.29 
 
 
138 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0110304 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1214  hypothetical protein  31.62 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000175016  normal  0.800065 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0735  hypothetical protein  37.4 
 
 
116 aa  60.1  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0236  hypothetical protein  43.66 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0333  hypothetical protein  37.84 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00389128  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4062  hypothetical protein  27.88 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3352  hypothetical protein  28.32 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0561  hypothetical protein  28.57 
 
 
140 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00605837  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_526  hypothetical protein  27.55 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000558785  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0587  hypothetical protein  27.55 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1239  transcriptional regulator, XRE family  30.85 
 
 
235 aa  40.8  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>