18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6677 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6677  hypothetical protein  100 
 
 
545 aa  1098    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217849  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4698  putative lipoprotein  31.91 
 
 
172 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000879271 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0520  hypothetical protein  35.92 
 
 
172 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0569  putative lipoprotein  32.81 
 
 
173 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000903334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0658  putative lipoprotein  32.81 
 
 
172 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9941600000000005e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0729  putative lipoprotein  32.81 
 
 
172 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0602  putative lipoprotein  32.81 
 
 
172 aa  62.4  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0513  hypothetical protein  32.81 
 
 
173 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000669276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0511  hypothetical protein  32.81 
 
 
173 aa  62.4  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0779722  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0516  hypothetical protein  35.92 
 
 
172 aa  62  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0640  putative lipoprotein  31.21 
 
 
172 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0670  hypothetical protein  36.27 
 
 
172 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0115  hypothetical protein  31.94 
 
 
277 aa  57  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.38 
 
 
3602 aa  51.6  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0925  SH3 type 3 domain protein  25.62 
 
 
654 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0177917  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0529  hypothetical protein  33.64 
 
 
372 aa  48.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0871  SH3 type 3 domain protein  23.38 
 
 
632 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4012  hypothetical protein  31.36 
 
 
274 aa  47  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>