30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6311 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6311  TfuA domain protein core  100 
 
 
464 aa  906    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3471  TfuA domain-containing protein  42.11 
 
 
451 aa  239  9e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4529  TfuA domain-containing protein  44.3 
 
 
234 aa  159  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.357658  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1332  TfuA domain-containing protein  46.23 
 
 
217 aa  153  8e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2070  TfuA-like protein  40.19 
 
 
214 aa  150  4e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2956  TfuA domain protein core  44.08 
 
 
235 aa  147  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3204  TfuA domain protein core  42.65 
 
 
235 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.909027  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1989  TfuA domain-containing protein  44.13 
 
 
258 aa  139  8.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.322278  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0590  hypothetical protein  40.09 
 
 
213 aa  138  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0804976  hitchhiker  0.00134813 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1210  TfuA domain protein core  41.67 
 
 
208 aa  137  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2262  TfuA-like  43.98 
 
 
238 aa  134  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.154499  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0861  TfuA-like protein  44.77 
 
 
403 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.060609  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0526  TfuA-like, core  38.43 
 
 
213 aa  132  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0822  hypothetical protein  41.43 
 
 
219 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7196  TfuA domain protein core  35.51 
 
 
247 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.503615  normal  0.0994766 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11405  hypothetical protein  40.72 
 
 
497 aa  129  8.000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000176066  normal  0.617932 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6038  TfuA domain protein core  34.84 
 
 
247 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.345548  normal  0.623723 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6107  TfuA domain-containing protein  33.33 
 
 
456 aa  128  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.620154  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1977  TfuA domain-containing protein  40.19 
 
 
216 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0265574  normal  0.793064 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1402  TfuA domain-containing protein  41.97 
 
 
208 aa  127  5e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0014  hypothetical protein  30.08 
 
 
344 aa  126  8.000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.175575  n/a   
 
 
-
 
NC_006366  plpl0010  hypothetical protein  39.32 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0918  TfuA domain-containing protein  43.68 
 
 
411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.124979  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0910  TfuA domain protein core  43.6 
 
 
403 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000252164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0906  TfuA domain protein core  43.35 
 
 
402 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.976855  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0428  TfuA domain-containing protein  31.96 
 
 
218 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0481  TfuA domain-containing protein  29.68 
 
 
214 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1564  TfuA domain-containing protein  29.68 
 
 
214 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0355  TfuA domain-containing protein  28.31 
 
 
214 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00180468 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1703  hypothetical protein  37.62 
 
 
882 aa  90.5  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>