13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4567 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4567  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  154  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1771  hypothetical protein  52.31 
 
 
93 aa  77.8  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.55323e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3607  hypothetical protein  39.06 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0214237  hitchhiker  0.00163709 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0155  hypothetical protein  39.19 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00000493853  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0974  hypothetical protein  36.76 
 
 
69 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.127017 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2183  hypothetical protein  33.33 
 
 
68 aa  51.2  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.167922  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06000  hypothetical protein  34.38 
 
 
91 aa  50.4  0.000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2104  hypothetical protein  37.5 
 
 
68 aa  50.4  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0170736  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2325  hypothetical protein  38.33 
 
 
90 aa  47.4  0.00006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3254  hypothetical protein  30.88 
 
 
93 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.569308  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3957  Protein of unknown function DUF2061, membrane  31.25 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43360  predicted protein  36.76 
 
 
248 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_41356  predicted protein  40 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>