13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4240 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4240  NADH dehydrogenase (quinone)  100 
 
 
212 aa  411  1e-114  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1273  hypothetical protein  37.76 
 
 
334 aa  72.4  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2648  hypothetical protein  33.77 
 
 
339 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0608226  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1210  hypothetical protein  36.29 
 
 
321 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0200595 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1107  hypothetical protein  41.54 
 
 
315 aa  63.9  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.497392  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0108  hypothetical protein  39.45 
 
 
337 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4640  hypothetical protein  38.1 
 
 
168 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2757  hypothetical protein  25.58 
 
 
154 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24460  hypothetical protein  36.36 
 
 
339 aa  46.6  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.760342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3222  hypothetical protein  33.73 
 
 
333 aa  46.2  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2409  hypothetical protein  33.67 
 
 
328 aa  43.1  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1109  hypothetical protein  32.76 
 
 
333 aa  42.7  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.334333  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0587  hypothetical protein  21.12 
 
 
159 aa  41.6  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>