23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4144 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4144  Lanthionine synthetase C family protein  100 
 
 		 491 aa  942    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.732259  normal  0.0439523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3102  Lanthionine synthetase C family protein  42.63 
 
 		 466 aa  254  3e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.220551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0555  Lanthionine synthetase C family protein  33.44 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1439  Lanthionine synthetase C family protein  28.38 
 
 		 404 aa  146  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4705  Lanthionine synthetase C family protein  25.12 
 
 		 414 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4693  Lanthionine synthetase C family protein  34.84 
 
 		 385 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3397  Lanthionine synthetase C family protein  23.31 
 
 		 391 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1333  lanthionine synthetase C family protein  32.24 
 
 		 436 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.551355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3314  hypothetical protein  27.47 
 
 		 381 aa  76.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1822  hypothetical protein  30.05 
 
 		 408 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.961315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2800  lanthionine synthetase C family protein  36.54 
 
 		 399 aa  74.3  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1126  lanthionine synthetase C-like  26.46 
 
 		 405 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6754  lanthionine synthetase C family protein  28.87 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0603  lanthionine synthetase C family protein  31.18 
 
 		 420 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3937  Lanthionine synthetase C family protein  27.1 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207083  normal  0.0864973 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5418  Lanthionine synthetase C family protein  32.02 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3603  Lanthionine synthetase C family protein  29.78 
 
 		 409 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.853914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2032  hypothetical protein  32.93 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3531  hypothetical protein  32.08 
 
 		 427 aa  57  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0966276  normal  0.218294 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4648  Lanthionine synthetase C family protein  30.41 
 
 		 390 aa  51.2  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0055  lanthionine synthetase C family protein  29.67 
 
 		 395 aa  50.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3154  serine/threonine protein kinase  23.21 
 
 		 713 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3997  hypothetical protein  37.1 
 
 		 242 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.366143  normal  0.539174 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>