14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1945 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1945  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  830    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00538103  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0985  hypothetical protein  52.9 
 
 		 403 aa  420  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3426  hypothetical protein  41.46 
 
 		 428 aa  301  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00293967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4870  hypothetical protein  41.45 
 
 		 955 aa  290  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4282  hypothetical protein  38.85 
 
 		 415 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4943  hypothetical protein  39.13 
 
 		 411 aa  279  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5532  hypothetical protein  41.33 
 
 		 396 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.232647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4176  hypothetical protein  39.64 
 
 		 415 aa  272  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.616398  normal  0.713554 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2992  hypothetical protein  39.85 
 
 		 403 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3051  tetratricopeptide TPR_4  32.62 
 
 		 499 aa  130  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3543  hypothetical protein  27.8 
 
 		 329 aa  76.3  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2412  hypothetical protein  26.81 
 
 		 333 aa  73.9  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.105862 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2616  lysine biosynthesis enzyme LysX  22.57 
 
 		 294 aa  49.7  0.00009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0444  lysine biosynthesis enzyme LysX  23.53 
 
 		 272 aa  48.9  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0001654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>