14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1469 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1469    100 
 
 
735 bp  1457    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2554  transposase  85.87 
 
 
294 bp  244  2.9999999999999997e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.191723 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2552    95.61 
 
 
114 bp  186  6e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.134462 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1903  transposase  84.04 
 
 
192 bp  135  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0858  transposase  85.81 
 
 
681 bp  133  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4099    90.38 
 
 
631 bp  127  5e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0142    87.29 
 
 
690 bp  115  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0709902  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0066    85.71 
 
 
143 bp  105  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.131513 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0067    85.5 
 
 
138 bp  85.7  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.127217 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1212    81.56 
 
 
338 bp  77.8  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.733032 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1894    85.71 
 
 
581 bp  71.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1839    82.24 
 
 
588 bp  58  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00715999  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0069    87.5 
 
 
69 bp  56  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0834298 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3914  Integrase catalytic region  83.12 
 
 
678 bp  50.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.835776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>