8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3518 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3518  phage integrase  100 
 
 		 414 aa  850    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3790  integrase family protein  46.51 
 
 		 408 aa  377  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3025  hypothetical protein  38.5 
 
 		 430 aa  283  4.0000000000000003e-75  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5147  hypothetical protein  40.1 
 
 		 423 aa  261  1e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3340  hypothetical protein  34.87 
 
 		 473 aa  258  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2829  hypothetical protein  34.22 
 
 		 435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2801  hypothetical protein  27.18 
 
 		 452 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1605  integrase family protein  25.88 
 
 		 453 aa  45.8  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0820528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>