12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3440 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012030  Hlac_3440  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  644    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2942  transposase IS4 family protein  26.85 
 
 		 558 aa  91.7  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1891  hypothetical protein  36.21 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.092595 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3154  hypothetical protein  36.04 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1353  transposase IS4 family protein  28.57 
 
 		 370 aa  70.1  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0718  transposase, IS4 family protein  26.92 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0553723  normal  0.0430259 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0717  hypothetical protein  25.21 
 
 		 369 aa  65.5  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.137739  normal  0.0455939 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3062  transposase IS4 family protein  26.82 
 
 		 584 aa  65.1  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2828  transposase IS4 family protein  35.96 
 
 		 692 aa  53.1  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3793  transposase IS4 family protein  36.36 
 
 		 628 aa  50.1  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.209171  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3567  transposase IS4 family protein  35.59 
 
 		 687 aa  47  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2096  transposase (TCE33)  34.78 
 
 		 142 aa  45.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.966509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>