20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2504 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1871  Protein of unknown function DUF460  64.32 
 
 
657 aa  788    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0054  Protein of unknown function DUF460  66.13 
 
 
658 aa  817    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0706  Protein of unknown function DUF460  63.8 
 
 
658 aa  749    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474274  normal  0.739297 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2183  Protein of unknown function DUF460  61.9 
 
 
658 aa  740    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2504  Protein of unknown function DUF460  100 
 
 
697 aa  1372    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.459934 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0547  hypothetical protein  36.51 
 
 
654 aa  403  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0419873  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3698  hypothetical protein  36.38 
 
 
662 aa  397  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.376692 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0481  hypothetical protein  35.46 
 
 
650 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.93354  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1193  Protein of unknown function DUF460  33.92 
 
 
669 aa  326  7e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2320  hypothetical protein  31.53 
 
 
663 aa  313  9e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2604  hypothetical protein  32.9 
 
 
646 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0435  hypothetical protein  27.75 
 
 
767 aa  226  9e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0232  hypothetical protein  31.21 
 
 
602 aa  169  1e-40  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0116565 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0738  hypothetical protein  35.81 
 
 
662 aa  168  4e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.00000149054  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1179  Protein of unknown function DUF460  28.12 
 
 
613 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.237227  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2334  hypothetical protein  33.59 
 
 
585 aa  143  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0927872  hitchhiker  0.00309238 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0690  hypothetical protein  30.48 
 
 
591 aa  140  7e-32  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.120921 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0863  hypothetical protein  28.12 
 
 
639 aa  139  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.949823  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1976  hypothetical protein  32.52 
 
 
584 aa  127  8.000000000000001e-28  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2104  hypothetical protein  32.33 
 
 
583 aa  127  9e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>