19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1269 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_1269  protein of unknown function DUF302  100 
 
 
154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2611  protein of unknown function DUF302  37.97 
 
 
154 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1112  protein of unknown function DUF302  34.94 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1827  hypothetical protein  35 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3325  protein of unknown function DUF302  30.3 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.847441  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1964  protein of unknown function DUF302  30.11 
 
 
280 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4400  hypothetical protein  27.66 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.713122 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4277  protein of unknown function DUF302  36.71 
 
 
146 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.486441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2260  protein of unknown function DUF302  27.96 
 
 
280 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0204221  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0142  hypothetical protein  31.25 
 
 
134 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2285  hypothetical protein  31.65 
 
 
128 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0451006  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3939  hypothetical protein  29.17 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3601  hypothetical protein  29.17 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.108169 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2269  hypothetical protein  28.95 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.228158  normal  0.126778 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4881  hypothetical protein  28.95 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.489198 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5312  hypothetical protein  28.41 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.849521  normal  0.398368 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5697  hypothetical protein  28.41 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.141635  normal  0.71056 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0970  hypothetical protein  40 
 
 
129 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000354639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3677  hypothetical protein  27.27 
 
 
137 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.134644  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>