22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0524 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0524  putative transcriptional regulator, CopG family  100 
 
 		 59 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221557  normal  0.567376 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0981  putative transcriptional regulator, CopG/Arc/MetJ family  74.58 
 
 		 59 aa  92  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0146172  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2407  putative transcriptional regulator, CopG family  74.19 
 
 		 62 aa  90.9  5e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2824  putative transcriptional regulator, CopG family  74.58 
 
 		 59 aa  90.9  6e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0168  putative transcriptional regulator, CopG family  75.93 
 
 		 62 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1405  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.000000545098  normal  0.171079 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2152  putative transcriptional regulator, CopG family  50.85 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.766946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0941  transcriptional regulator  59.57 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.119316  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0744  CopG family transcriptional regulator  53.19 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.605569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1448  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0796  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 87 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0399  CopG family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.347703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1563  CopG family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0593  CopG family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.945444 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0536  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 58 aa  47.4  0.00006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1956  CopG family transcriptional regulator  47.5 
 
 		 68 aa  47  0.00008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0638  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 54 aa  44.7  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1613  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 65 aa  43.5  0.0009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.877119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0668  CopG/Arc/MetJ family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0926  putative transcriptional regulator, CopG family  34.78 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0102  CopG family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.433684  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1400  putative transcriptional regulators, CopG/Arc/MetJ family  32.56 
 
 		 50 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.562472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>