29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2241 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2241  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  181  3e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0158204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2546  hypothetical protein  41.76 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.666952  normal  0.103184 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1151  hypothetical protein  40.66 
 
 
106 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2512  hypothetical protein  39.56 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3513  hypothetical protein  39.56 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3270  hypothetical protein  39.56 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1293  hypothetical protein  39.56 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0434  hypothetical protein  39.56 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.635007  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3515  hypothetical protein  38.46 
 
 
106 aa  52.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3477  hypothetical protein  38.46 
 
 
106 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159359  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1813  hypothetical protein  38.46 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2616  hypothetical protein  39.53 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00109399  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2962  hypothetical protein  34.25 
 
 
86 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0630977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2945  hypothetical protein  31.94 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.875889  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3628  hypothetical protein  37.84 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.762255  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0378  hypothetical protein  35.37 
 
 
86 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115206 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3092  hypothetical protein  33.33 
 
 
90 aa  45.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.415366  normal  0.828492 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0721  hypothetical protein  40 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000996835  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2938  hypothetical protein  37.84 
 
 
76 aa  43.5  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.453389  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0868  hypothetical protein  32.89 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.101453 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0592  hypothetical protein  57.58 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0110  hypothetical protein  57.58 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0562  hypothetical protein  57.58 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.16849  hitchhiker  0.000497544 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1505  hypothetical protein  50 
 
 
86 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3677  hypothetical protein  57.58 
 
 
105 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.282703  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0967  hypothetical protein  32.93 
 
 
80 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.284215  normal  0.586878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0825  hypothetical protein  35.53 
 
 
108 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.866188  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2122  hypothetical protein  25.27 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0754544 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0216  hypothetical protein  35.82 
 
 
117 aa  40  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.575652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>