31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1756 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_1756  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  217  5e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0652  hypothetical protein  44.83 
 
 
102 aa  68.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3713  hypothetical protein  44.59 
 
 
102 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0329  hypothetical protein  41.25 
 
 
110 aa  58.5  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4094  hypothetical protein  43.24 
 
 
109 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4177  hypothetical protein  43.24 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2194  hypothetical protein  39.39 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0443  hypothetical protein  32.97 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3015  hypothetical protein  33.68 
 
 
111 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1264  hypothetical protein  32.58 
 
 
127 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4507  hypothetical protein  39.29 
 
 
112 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36200  Plasmid hypothetical protein, RAQPRD  37.5 
 
 
118 aa  52  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1172  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  32.58 
 
 
126 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0956  hypothetical protein  40.45 
 
 
121 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2345  hypothetical protein  32.58 
 
 
127 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000024781  unclonable  0.000000135076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1406  putative secreted protein  33.71 
 
 
126 aa  51.2  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0449246  normal  0.883784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2386  hypothetical protein  34.55 
 
 
115 aa  50.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3416  hypothetical protein  32.56 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.199537  normal  0.0728248 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59860  putative type III effector Hop protein  38.1 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0114799  hitchhiker  0.000000000000152109 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2940  hypothetical protein  34.07 
 
 
119 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0368  hypothetical protein  38.89 
 
 
203 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1975  hypothetical protein  29.67 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.793487  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2851  plasmid conserved hypothetical protein RAQPRD  35.14 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.410832  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4171  hypothetical protein  31.76 
 
 
127 aa  48.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0787775  normal  0.908625 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0675  hypothetical protein  35.9 
 
 
128 aa  47.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1192  hypothetical protein  30.77 
 
 
127 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0476297  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1634  hypothetical protein  34.83 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1450  hypothetical protein  36.76 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0869  hypothetical protein  36.76 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0510  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0640  hypothetical protein  30 
 
 
100 aa  40.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>