13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0867 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008309  HS_0867  permease  100 
 
 
284 aa  552  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1090  integral membrane protein  45.39 
 
 
277 aa  225  6e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7126  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.35 
 
 
288 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0091  hypothetical protein  42.96 
 
 
282 aa  198  9e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4335  hypothetical protein  43.55 
 
 
284 aa  196  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.723653  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0084  hypothetical protein  42.96 
 
 
282 aa  195  6e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.773078  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0109  hypothetical protein  43.58 
 
 
294 aa  195  7e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0476827  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.98 
 
 
296 aa  175  9e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.64382  normal  0.755088 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0202  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.21 
 
 
285 aa  102  9e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251862  normal  0.467079 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2510  hypothetical protein  24.66 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12723  hypothetical protein  25.56 
 
 
256 aa  57.8  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1431  hypothetical protein  26.57 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.185766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2483  membrane protein containing DUF6  19.94 
 
 
315 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.886177  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>