More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0587 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0587  FtsK/SpoIIIE family protein  100 
 
 
607 aa  1255    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.58399 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0763  DNA segregation ATPase  44.31 
 
 
608 aa  393  1e-108  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0457754  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3790  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.08 
 
 
1346 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0289284  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2606  cell divisionFtsK/SpoIIIE  43.7 
 
 
1438 aa  186  7e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0412  cell divisionFtsK/SpoIIIE  42.92 
 
 
1604 aa  185  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.62711 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4147  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.62 
 
 
1502 aa  180  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3123  cell divisionFtsK/SpoIIIE  44.69 
 
 
1446 aa  180  8e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.341793  decreased coverage  0.000461331 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4268  FHA domain containing protein  42.67 
 
 
1399 aa  177  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3390  cell division FtsK/SpoIIIE  40.52 
 
 
1477 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000563545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1741  FHA domain-containing protein  44.04 
 
 
1484 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.082515  normal  0.707521 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2426  FHA domain containing protein  41.52 
 
 
1346 aa  171  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0389758 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21520  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  40 
 
 
1488 aa  171  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1296  FHA domain-containing protein  29.88 
 
 
1493 aa  171  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8141  cell divisionFtsK/SpoIIIE  41.78 
 
 
1463 aa  171  5e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2826  cell divisionFtsK/SpoIIIE  40.21 
 
 
1065 aa  171  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1302  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  40.73 
 
 
1528 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0493  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.04 
 
 
1478 aa  169  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2394  cell division FtsK/SpoIIIE  41.57 
 
 
1317 aa  169  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.206557  hitchhiker  0.00430147 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1419  FHA domain containing protein  40.87 
 
 
1468 aa  169  1e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.49197  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1340  FHA domain containing protein  36.82 
 
 
1481 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000482436 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2695  FHA domain-containing protein  40.53 
 
 
1363 aa  169  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0693  cell division FtsK/SpoIIIE  36.09 
 
 
1615 aa  167  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0271  cell divisionFtsK/SpoIIIE  37.1 
 
 
1479 aa  164  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0278  cell division protein FtsK/SpoIIIE  37.1 
 
 
1479 aa  164  6e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.50338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1334  FHA domain containing protein  31.76 
 
 
1488 aa  164  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1146  FHA domain containing protein  41.05 
 
 
1456 aa  162  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.65239  hitchhiker  0.000278165 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0638  FHA domain-containing protein  38.71 
 
 
1559 aa  161  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.449825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3216  ftsk/spoiiie family protein  32.45 
 
 
1501 aa  160  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.616613  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1577  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.12 
 
 
1501 aa  160  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.887078  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1917  FtsK/SpoIIIE family protein  32.45 
 
 
1503 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.054291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2089  ftsk/spoiiie family protein  32.45 
 
 
1503 aa  159  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1985  FtsK/SpoIIIE family protein  30.19 
 
 
1342 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6708  FHA domain containing protein  38.77 
 
 
1447 aa  157  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.22959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0805  cell divisionFtsK/SpoIIIE  36.91 
 
 
1467 aa  157  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.890485  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2035  FtsK/SpoIIIE family protein  30.19 
 
 
1342 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2209  FtsK/SpoIIIE family protein  30.19 
 
 
1335 aa  157  8e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.32787e-22 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2190  FtsK/SpoIIIE family protein  30.19 
 
 
1342 aa  156  8e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491476  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1033  FtsK/SpoIIIE family protein  35.86 
 
 
1309 aa  155  2.9999999999999998e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2025  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.03 
 
 
1336 aa  153  7e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.436887  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2124  cell divisionFtsK/SpoIIIE  39.82 
 
 
1579 aa  153  7e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.15343  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3495  cell divisionFtsK/SpoIIIE  38.74 
 
 
1555 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.733864  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6260  cell divisionFtsK/SpoIIIE  43.62 
 
 
895 aa  150  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.672638 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2470  cell divisionFtsK/SpoIIIE  36.08 
 
 
1249 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.923586  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07490  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  39.74 
 
 
999 aa  149  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2581  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.03 
 
 
2947 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1153  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.03 
 
 
1229 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.718095  normal  0.251355 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1143  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.03 
 
 
1229 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.727528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1126  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30.03 
 
 
1229 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0694  cell division FtsK/SpoIIIE  34.43 
 
 
1336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.809205 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1438  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.47 
 
 
1278 aa  126  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.229363  normal  0.229746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13484  hypothetical protein  24.95 
 
 
1236 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.230373  hitchhiker  0.00886198 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0679  cell division FtsK/SpoIIIE  35.12 
 
 
1335 aa  123  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0517102 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4753  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.01 
 
 
1315 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0295916  hitchhiker  0.000421032 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0939  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.74 
 
 
1312 aa  122  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0991  cell division FtsK/SpoIIIE  34.4 
 
 
1340 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1968  cell divisionFtsK/SpoIIIE  30 
 
 
1066 aa  120  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0407  cell division FtsK/SpoIIIE  34.73 
 
 
1316 aa  119  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0474  cell divisionFtsK/SpoIIIE  34.96 
 
 
1318 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0770518  decreased coverage  0.00818473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7884  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.06 
 
 
1348 aa  119  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0456902 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0607  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.71 
 
 
1315 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8520  cell divisionFtsK/SpoIIIE  35.09 
 
 
1336 aa  117  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0195217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0303  cell divisionFtsK/SpoIIIE  33.47 
 
 
1326 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.313665  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5430  cell division protein FtsK/SpoIIIE  31.64 
 
 
1303 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04110  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  27.14 
 
 
1360 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4625  cell division protein FtsK/SpoIIIE  26.59 
 
 
1332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18785  normal  0.38778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4810  cell division FtsK/SpoIIIE  32.71 
 
 
1316 aa  115  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.116286  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4959  cell divisionFtsK/SpoIIIE  27.81 
 
 
1183 aa  114  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.156858  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0056  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.92 
 
 
745 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.627521  hitchhiker  0.00968716 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8474  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.65 
 
 
1349 aa  114  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0066  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.92 
 
 
745 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0075  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.92 
 
 
745 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0751405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0771  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.57 
 
 
742 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.897742 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1210  cell division protein FtsK/SpoIIIE  32.82 
 
 
1320 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.978992  normal  0.356707 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8101  DNA segregation ATPase FtsK/SpoIIIE and related protein-like protein  32.79 
 
 
1327 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0331826  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4837  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.91 
 
 
1320 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.786976  decreased coverage  0.000163862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0074  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.57 
 
 
740 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.669354  normal  0.0493616 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13905  transmembrane protein  28.14 
 
 
747 aa  111  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3214  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.9 
 
 
1330 aa  109  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.248908 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2491  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.91 
 
 
1313 aa  110  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717331  normal  0.28838 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1683  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.92 
 
 
1359 aa  108  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0865  cell division FtsK/SpoIIIE  31.43 
 
 
1335 aa  108  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.351933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3145  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.1 
 
 
1333 aa  105  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04380  DNA segregation ATPase, FtsK/SpoIIIE family  30.04 
 
 
1334 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.765844  normal  0.632338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6571  cell divisionFtsK/SpoIIIE  29.29 
 
 
1333 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.295445  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1796  cell divisionFtsK/SpoIIIE  32.73 
 
 
1274 aa  94.7  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.988037  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1831  cell division protein FtsK/SpoIIIE  32.73 
 
 
1274 aa  94.7  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.953109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0361  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.69 
 
 
1321 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563466  normal  0.967672 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0372  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.69 
 
 
1321 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0382  cell divisionFtsK/SpoIIIE  28.69 
 
 
1321 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.612142  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1030  putative cell division protein FtsK  30.11 
 
 
945 aa  92.4  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.456142  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0907  cell divisionFtsK/SpoIIIE  31.02 
 
 
744 aa  92.4  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00620171  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1301  FtsK/SpoIIIE family protein  32.27 
 
 
1169 aa  92  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00978119  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0965  cell division protein FtsK, putative  30.11 
 
 
941 aa  92  3e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0893  cell division protein FtsK, putative  30.11 
 
 
946 aa  92  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1296  FtsK/SpoIIIE family protein  30.92 
 
 
693 aa  91.7  4e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.557352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1265  DNA translocase FtsK  31.07 
 
 
740 aa  91.3  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1050  DNA translocase ftsk (DNA translocase SpoIIIE)  31.6 
 
 
679 aa  90.9  6e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl100  DNA translocase (stage III sporulation protein E)  31.63 
 
 
953 aa  90.5  7e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1648  DNA translocase FtsK  29.33 
 
 
796 aa  90.9  7e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1289  cell division FtsK/SpoIIIE  31.9 
 
 
922 aa  90.5  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.266867  normal  0.306539 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>