18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0566 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0566  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00656687 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08196  hypothetical protein  31.58 
 
 		 274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  hitchhiker  0.00000170796  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2315  hypothetical protein  30.49 
 
 		 296 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.106853  hitchhiker  0.000000000000558489 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0261  hypothetical protein  31.03 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.205526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0798  hypothetical protein  30 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1649  hypothetical protein  27.65 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.432038  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0963  hypothetical protein  32.79 
 
 		 365 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.369617  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0074  hypothetical protein  28.57 
 
 		 309 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000070418  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1612  hypothetical protein  25.26 
 
 		 269 aa  68.9  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0653  hypothetical protein  25.12 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.395081  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1885  hypothetical protein  25.45 
 
 		 288 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.911612 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02980  hypothetical protein  21.12 
 
 		 330 aa  49.3  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2823  hypothetical protein  30.08 
 
 		 297 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1137  hypothetical protein  26.36 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2563  hypothetical protein  21.66 
 
 		 304 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2026  hypothetical protein  23.04 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2029  hypothetical protein  24.75 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.721418  normal  0.623981 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3495  hypothetical protein  22.39 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>