26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_0512 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_0512  toxin-antitoxin system, antitoxin component, PHD family  100 
 
 		 84 aa  170  5e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00233462 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0396  prevent-host-death family protein  73.49 
 
 		 86 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1954  prevent-host-death family protein  59.04 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2346  prevent-host-death family protein  52.5 
 
 		 91 aa  91.3  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.940595 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03810  prevent-host-death family protein  53.75 
 
 		 88 aa  90.9  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1455  prevent-host-death family protein  47.62 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13710  prevent-host-death family protein  42.35 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000922616  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4124  prevent-host-death family protein  47.89 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000234799  hitchhiker  0.00000000380976 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4491  prevent-host-death family protein  37.65 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000030165  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0576  prevent-host-death family protein  36.9 
 
 		 90 aa  52  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000390298  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2220  prevent-host-death family protein  34.12 
 
 		 87 aa  52  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2206  prevent-host-death family protein  43.55 
 
 		 90 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000169493  hitchhiker  0.00000000153827 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0648  prevent-host-death family protein  36.47 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000197099  unclonable  0.0000000000981851 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0628  prevent-host-death family protein  36.47 
 
 		 86 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000258599  unclonable  0.0000000000739074 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3875  prevent-host-death family protein  35 
 
 		 89 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3189  prevent-host-death family protein  41.38 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3301  prevent-host-death family protein  56.52 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000616383  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0291  hypothetical protein  33.73 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2209  prevent-host-death family protein  52.17 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000546221  unclonable  0.0000000000598277 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2468  prevent-host-death family protein  40.43 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2783  prevent-host-death family protein  36.96 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.686877 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1972  prevent-host-death family protein  33.33 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1690  prevent-host-death family protein  31.25 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2330  prevent-host-death family protein  34.78 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0751  prevent-host-death family protein  38.64 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1277  prevent-host-death protein  34.29 
 
 		 93 aa  40  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.913531 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>