16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3923 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3923  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 395 aa  811    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0730  type IV pilus assembly PilZ  42.6 
 
 		 331 aa  271  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000601574 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0717  type IV pilus assembly PilZ  42.6 
 
 		 331 aa  264  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1766  type IV pilus assembly PilZ  28.23 
 
 		 381 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2187  type IV pilus assembly PilZ  30.07 
 
 		 351 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1757  hypothetical protein  29.38 
 
 		 330 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.431367  normal  0.111889 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1240  hypothetical protein  30.21 
 
 		 332 aa  116  6e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0044  type IV pilus assembly PilZ  26.79 
 
 		 276 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0320  type IV pilus assembly PilZ  27.82 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3536  type IV pilus assembly PilZ  24.63 
 
 		 250 aa  87.4  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3602  type IV pilus assembly PilZ  24.72 
 
 		 242 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0347  type IV pilus assembly PilZ  24.36 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.97543e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0366  type IV pilus assembly PilZ  24.64 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0459  hypothetical protein  25.3 
 
 		 259 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4082  type IV pilus assembly PilZ  25.93 
 
 		 264 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3033  hypothetical protein  23.26 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>