11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3548 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3548  thiamineS protein  100 
 
 		 81 aa  164  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000742651  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1007  thiamineS protein  39.51 
 
 		 79 aa  51.6  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00214201  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1876  thiamineS protein  33.33 
 
 		 74 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  35.8 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1283  hypothetical protein  35.8 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1774  thiamineS protein  35.8 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0173  thiamineS protein  32.1 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00650406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2271  thiamineS protein  32.1 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0329  molybdopterin converting factor, subunit 1  32.18 
 
 		 224 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00555526  decreased coverage  0.00329133 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2123  thiamineS protein  28.24 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.710919  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  34.48 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>