21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2995 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2995  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  100 
 
 
120 aa  245  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2429  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  45.28 
 
 
120 aa  104  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0188402  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2621  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  43.56 
 
 
120 aa  99  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2941  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40.21 
 
 
116 aa  86.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1592  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  38.66 
 
 
120 aa  82  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1281  anti-sigma-factor antagonist  40.62 
 
 
116 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946489 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1740  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  38.74 
 
 
118 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000969035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2712  hypothetical protein  34.15 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0632  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
105 aa  57.4  0.00000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1605  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  25.89 
 
 
115 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.573914  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04746  stas domain, putative  35 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.428672  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3295  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  36.11 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1120  hypothetical protein  35.37 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0237  putative CheA signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
669 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0874018 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0331  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 
105 aa  45.4  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1645  putative CheA signal transduction histidine kinases  30.86 
 
 
731 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.954739 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1418  hypothetical protein  33.9 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.123282  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2649  hypothetical protein  33.9 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1141  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  41.18 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  29.03 
 
 
563 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0787  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  38.1 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>