23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1796 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1796  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  282  9e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00914712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2688  hypothetical protein  71.32 
 
 
135 aa  183  6e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000329796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1528  hypothetical protein  68.99 
 
 
135 aa  180  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.238121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0953  hypothetical protein  60.71 
 
 
114 aa  151  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2048  hypothetical protein  54.17 
 
 
133 aa  135  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000179688  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2488  hypothetical protein  48.78 
 
 
131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2318  hypothetical protein  35.16 
 
 
130 aa  85.9  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000668387  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0143  hypothetical protein  28.57 
 
 
341 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109428  normal  0.11094 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0161  hypothetical protein  28.57 
 
 
341 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853384  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5084  hypothetical protein  27.68 
 
 
340 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0424557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0159  hypothetical protein  27.68 
 
 
340 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.860597 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3456  hypothetical protein  35.14 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072555 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0067  hypothetical protein  30.36 
 
 
397 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0036  hypothetical protein  27.43 
 
 
342 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.326703  normal  0.177153 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2394  hypothetical protein  30.11 
 
 
376 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3543  hypothetical protein  29.57 
 
 
365 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.571666  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0597  hypothetical protein  28.91 
 
 
157 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0120  hypothetical protein  29.46 
 
 
395 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6275  hypothetical protein  25.9 
 
 
340 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72300  hypothetical protein  26.79 
 
 
346 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1943  hypothetical protein  26.8 
 
 
342 aa  49.7  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.931712  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0839  hypothetical protein  26 
 
 
290 aa  47.4  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0331682  normal  0.920191 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01770  hypothetical protein  25.21 
 
 
337 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>