16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1360 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1360  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  216  7e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0020  hypothetical protein  41 
 
 
103 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.681343  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0441  hypothetical protein  40.38 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.423124  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2645  hypothetical protein  39.6 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.893359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1799  hypothetical protein  40.91 
 
 
103 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1571  hypothetical protein  32.04 
 
 
101 aa  60.1  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000356079  normal  0.0472602 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0631  hypothetical protein  38.96 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.207272  normal  0.0397506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3092  hypothetical protein  32.04 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3911  hypothetical protein  31.18 
 
 
105 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3963  hypothetical protein  31.18 
 
 
105 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0613138  hitchhiker  0.000789455 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1426  hypothetical protein  36.54 
 
 
109 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2464  hypothetical protein  33.71 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000185704  hitchhiker  0.00000000555702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0955  hypothetical protein  31.07 
 
 
104 aa  52  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0329499 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0510  hypothetical protein  30.1 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.012362  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3811  hypothetical protein  27 
 
 
107 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3862  hypothetical protein  26.73 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.404726  normal  0.96775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>