18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0775 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0775  hypothetical protein  100 
 
 
112 aa  225  1e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3672  hypothetical protein  93.75 
 
 
112 aa  214  4e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1233  hypothetical protein  84.82 
 
 
112 aa  198  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.921092  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2339  hypothetical protein  57.14 
 
 
112 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2259  hypothetical protein  43.24 
 
 
119 aa  105  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000118561  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1158  hypothetical protein  46.46 
 
 
111 aa  98.6  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0041  hypothetical protein  43.93 
 
 
113 aa  87.8  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00636964  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0800  hypothetical protein  42 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1556  hypothetical protein  39.45 
 
 
108 aa  78.6  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2683  hypothetical protein  37.37 
 
 
109 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.828322  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1081  hypothetical protein  29.57 
 
 
115 aa  58.5  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00650626  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2654  hypothetical protein  33.93 
 
 
111 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39620  hypothetical protein  32.08 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.8273 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3361  hypothetical protein  32.08 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00221996  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4503  Protein of unknown function DUF2149  32.41 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.426307  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1478  hypothetical protein  32.08 
 
 
112 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1201  hypothetical protein  31.78 
 
 
112 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.240997  normal  0.738905 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0753  hypothetical protein  31.78 
 
 
112 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>