20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0700 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0700  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3896  hypothetical protein  35.77 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2808  hypothetical protein  37.38 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.691589  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0826  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 514 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2112  acetaldehyde dehydrogenase  38.46 
 
 		 314 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1640  acetaldehyde dehydrogenase  38.46 
 
 		 314 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal  0.308557 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1025  hypothetical protein  24.11 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2310  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  28.81 
 
 		 688 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0396  homoserine dehydrogenase, NAD-binding  28.35 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0451465  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2861  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  26.45 
 
 		 690 aa  47  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0440  acetaldehyde dehydrogenase (acetylating)  31.51 
 
 		 294 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.237883  normal  0.0145709 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0888  hypothetical protein  30.7 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.53908  normal  0.922606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5043  acetaldehyde dehydrogenase  26.88 
 
 		 310 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4748  acetaldehyde dehydrogenase  26.88 
 
 		 310 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473939  normal  0.158943 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13568  acetaldehyde dehydrogenase  30.26 
 
 		 303 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000208142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4660  acetaldehyde dehydrogenase  26.88 
 
 		 310 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2033  acetaldehyde dehydrogenase  32.43 
 
 		 303 aa  43.5  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4008  PAS modulated sigma54 specific transcriptional regulator  27.64 
 
 		 690 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3605  oxidoreductase domain-containing protein  31.82 
 
 		 450 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1521  acetaldehyde dehydrogenase  27.63 
 
 		 306 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>