18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1218 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1218  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  176  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1509  transposase IS3/IS911  67.27 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1532  transposase IS3/IS911 family protein  67.27 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2154  transposase IS3/IS911 family protein  67.27 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00432378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0800  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0801  Integrase catalytic region  83.33 
 
 		 291 aa  53.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2226  transposase IS3/IS911  46.94 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1973  transposase IS3/IS911 family protein  46.81 
 
 		 110 aa  42  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1726  transposase IS3/IS911  44.64 
 
 		 96 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.110151 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1861  transposase IS3/IS911  44.68 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.566952  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0678  transposase IS3/IS911 family protein  38.57 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0153  transposase IS3/IS911 family protein  48.89 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0302  transposase IS3/IS911 family protein  48.89 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0520  transposase IS3/IS911 family protein  48.89 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.455953  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0980  transposase IS3/IS911 family protein  48.89 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.571542  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0981  transposase IS3/IS911 family protein  48.89 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.267655  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1315  transposase IS3/IS911 family protein  48.89 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0494436  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1774  transposase IS3/IS911 family protein  48.89 
 
 		 109 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.985835  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>