13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1144 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1144  hypothetical protein  100 
 
 
499 aa  1005    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.548609  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1940  hypothetical protein  39.19 
 
 
467 aa  261  3e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.342271  normal  0.555742 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2985  hypothetical protein  36.51 
 
 
501 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5148  hypothetical protein  38.58 
 
 
479 aa  233  6e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.622976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1558  hypothetical protein  25.88 
 
 
403 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2024  hypothetical protein  28.61 
 
 
467 aa  90.5  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.534725  normal  0.110095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4898  hypothetical protein  27.59 
 
 
451 aa  78.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1329  hypothetical protein  25.85 
 
 
456 aa  75.1  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.295723  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1894  hypothetical protein  25.85 
 
 
462 aa  69.3  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.557849  normal  0.511267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1116  hypothetical protein  24.12 
 
 
484 aa  62.4  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1419  hypothetical protein  26.02 
 
 
358 aa  61.2  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0682  hypothetical protein  22.48 
 
 
442 aa  61.2  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1128  hypothetical protein  22.22 
 
 
505 aa  53.5  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.541844 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>