20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2488 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2488  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2048  hypothetical protein  55.83 
 
 
133 aa  144  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000179688  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0953  hypothetical protein  57.27 
 
 
114 aa  140  5e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1796  hypothetical protein  48.78 
 
 
137 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00914712  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2688  hypothetical protein  44.88 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000329796 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1528  hypothetical protein  50 
 
 
135 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.238121  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2318  hypothetical protein  36.22 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000668387  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0161  hypothetical protein  29.57 
 
 
341 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853384  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0143  hypothetical protein  29.57 
 
 
341 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109428  normal  0.11094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0159  hypothetical protein  28.45 
 
 
340 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.860597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0597  hypothetical protein  29.81 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01770  hypothetical protein  31.03 
 
 
337 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2394  hypothetical protein  30.09 
 
 
376 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3456  hypothetical protein  31.08 
 
 
154 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3673  hypothetical protein  26.32 
 
 
135 aa  42.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5084  hypothetical protein  26.09 
 
 
340 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0424557 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6275  hypothetical protein  25.18 
 
 
340 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1943  hypothetical protein  24.3 
 
 
342 aa  42  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.931712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72300  hypothetical protein  25.18 
 
 
346 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0067  hypothetical protein  25.18 
 
 
397 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>