16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1766 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1766  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 
381 aa  780    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2187  type IV pilus assembly PilZ  45.87 
 
 
351 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0320  type IV pilus assembly PilZ  38.46 
 
 
366 aa  221  9.999999999999999e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1757  hypothetical protein  31.52 
 
 
330 aa  172  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.431367  normal  0.111889 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0347  type IV pilus assembly PilZ  30.03 
 
 
329 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.97543e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1240  hypothetical protein  30.27 
 
 
332 aa  149  7e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0366  type IV pilus assembly PilZ  29.49 
 
 
329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3923  type IV pilus assembly PilZ  28.23 
 
 
395 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0717  type IV pilus assembly PilZ  26.23 
 
 
331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0044  type IV pilus assembly PilZ  26.51 
 
 
276 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0730  type IV pilus assembly PilZ  25 
 
 
331 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000601574 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4082  type IV pilus assembly PilZ  24.67 
 
 
264 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0459  hypothetical protein  26.91 
 
 
259 aa  96.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3536  type IV pilus assembly PilZ  26.23 
 
 
250 aa  79  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3602  type IV pilus assembly PilZ  25.57 
 
 
242 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3033  hypothetical protein  22.9 
 
 
267 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>