76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0526 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  337  5.9999999999999996e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  65.19 
 
 
160 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  64.78 
 
 
160 aa  214  4e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  62.89 
 
 
160 aa  206  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  68.03 
 
 
160 aa  202  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  64.63 
 
 
160 aa  194  6e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  59.48 
 
 
165 aa  176  9e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  34.07 
 
 
187 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  32.82 
 
 
159 aa  75.5  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  30.14 
 
 
162 aa  74.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  32.79 
 
 
167 aa  74.3  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  30.91 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  33.87 
 
 
146 aa  68.6  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  28.9 
 
 
218 aa  63.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1557  hypothetical protein  24.11 
 
 
151 aa  60.5  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  36.99 
 
 
200 aa  60.1  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  31.88 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  31.88 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1386  hypothetical protein  29.77 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02661  hypothetical protein  24.09 
 
 
151 aa  58.2  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  26.45 
 
 
178 aa  58.2  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  34.55 
 
 
165 aa  58.2  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  34.12 
 
 
234 aa  57.8  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  27.27 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  32.71 
 
 
186 aa  55.1  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  30.12 
 
 
171 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02081  hypothetical protein  28.23 
 
 
147 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.235056  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  34.09 
 
 
218 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  31.15 
 
 
210 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02081  hypothetical protein  34.56 
 
 
149 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.817359  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02101  hypothetical protein  27.42 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0337781  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0192  hypothetical protein  28.23 
 
 
147 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.373494  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  29.03 
 
 
395 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  28.36 
 
 
208 aa  52  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  32.28 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  34.09 
 
 
218 aa  51.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  32.94 
 
 
218 aa  50.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  32.94 
 
 
218 aa  50.8  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  33.33 
 
 
181 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0956  hypothetical protein  32.46 
 
 
179 aa  50.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  31.19 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  29.29 
 
 
175 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0898  hypothetical protein  32.73 
 
 
169 aa  48.1  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.749286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  30.89 
 
 
177 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  30.66 
 
 
377 aa  47.8  0.00007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  30.89 
 
 
177 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1201  Protein of unknown function DUF2062  29.46 
 
 
188 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0952689 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01533  hypothetical protein  28.44 
 
 
169 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  29.89 
 
 
210 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  30.4 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  31.01 
 
 
401 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003989  hypothetical protein  28.44 
 
 
169 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  25.78 
 
 
397 aa  45.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02191  hypothetical protein  31.69 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  26.12 
 
 
210 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  28.57 
 
 
208 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  30.17 
 
 
210 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2326  Protein of unknown function DUF2062  23.08 
 
 
167 aa  44.3  0.0008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  27.52 
 
 
174 aa  44.3  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  28.89 
 
 
163 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1335  hypothetical protein  27.78 
 
 
169 aa  43.5  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2626  hypothetical protein  27.56 
 
 
198 aa  43.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1701  hypothetical protein  30.4 
 
 
177 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0167634 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3259  hypothetical protein  26.17 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  30.17 
 
 
177 aa  42.4  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5943  hypothetical protein  39.47 
 
 
177 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0572526  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1984  glycosyl transferase family 2  26.32 
 
 
386 aa  42.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2201  hypothetical protein  28.93 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2804  hypothetical protein  27.97 
 
 
169 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1438  hypothetical protein  30.86 
 
 
196 aa  42  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.244282  normal  0.395476 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01852  flagellar biosynthesis protein FlhF  24.59 
 
 
174 aa  41.6  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  32.58 
 
 
185 aa  40.8  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  26.09 
 
 
169 aa  41.2  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0658  Protein of unknown function DUF2062  33.33 
 
 
179 aa  40.8  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1152  Protein of unknown function DUF2062  23.57 
 
 
165 aa  40.8  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1817  hypothetical protein  27.52 
 
 
168 aa  40.4  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0392533  normal  0.0810323 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>