148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2879 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2879  Colicin V production protein  100 
 
 		 182 aa  345  3e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.999004  normal  0.111961 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0404  colicin V production protein  37.13 
 
 		 187 aa  98.6  4e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0487  CvpA protein  27.27 
 
 		 187 aa  75.9  0.0000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.457709  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0454  putative colicin V production protein  34.97 
 
 		 192 aa  75.5  0.0000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0448  colicin V production protein, putative  34.97 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2310  colicin V production protein  31.14 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4616  colicin V production protein  35.76 
 
 		 164 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0414  Colicin V production protein  31.74 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.728843 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1553  colicin V production protein  38.53 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0745627  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2016  colicin V production protein  31.71 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.535943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2401  colicin V production protein  30.92 
 
 		 234 aa  67.8  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0984  colicin V production protein  35.17 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.769176  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2073  2-oxoglutarate dehydrogenase, E1 component  31.3 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.576692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2024  hypothetical protein  35.96 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2292  colicin V production protein  31.71 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23900  hypothetical protein  37.38 
 
 		 180 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00157781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1500  colicin V production protein  29.27 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  29.71 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3940  colicin V production protein  37.69 
 
 		 203 aa  64.3  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2453  colicin V production protein  29.81 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.921002 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0405  colicin V production protein  30.82 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3788  putative colicin V production protein, cvpA-like (dedE protein) (Pur regulon 18 kDa protein)  30.49 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.268967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0728  colicin V production protein  33.33 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.980387  normal  0.959798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2996  colicin V production protein  28.82 
 
 		 210 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.581672 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3564  colicin V production protein  37.75 
 
 		 164 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4403  colicin V production protein  37.75 
 
 		 164 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.454399  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3964  colicin V production protein  37.75 
 
 		 164 aa  62  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2119  colicin V production protein  37.75 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.73318  normal  0.0950051 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2283  colicin V production protein  34.26 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.11201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2875  putative bacteriocin production related protein  31.85 
 
 		 164 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2712  colicin V production protein  33.09 
 
 		 170 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240429  normal  0.143429 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0561  colicin V production protein  33.13 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.245346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34160  Colicin V production protein  35.51 
 
 		 170 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  33.33 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1693  colicin V production protein  35.11 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.339173 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1079  colicin V production protein (protein DedE)  30.56 
 
 		 163 aa  58.5  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  36.11 
 
 		 160 aa  58.2  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3500  Colicin V production protein  29.89 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1241  colicin V production protein  31.85 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.599135  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2490  CvpA family protein  31.61 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.904842  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  30.56 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4093  colicin V production protein  30.82 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.799722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  30.28 
 
 		 162 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3354  colicin V production protein  36.42 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0663199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2047  colicin V production protein  31.79 
 
 		 177 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.220439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3895  colicin V production protein  33.33 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507461  normal  0.187677 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3859  colicin V production protein  36.42 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2503  colicin V production protein  33.33 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002878  colicin V production protein  29.45 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4408  Colicin V production protein  33.33 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3933  colicin V production protein  33.33 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.838461  normal  0.0661094 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4301  Colicin V production protein  33.33 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.678611  normal  0.0583187 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1343  Colicin V production protein  31.29 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0732005  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2691  colicin V production protein  31.29 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2551  colicin V production protein  35.04 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2505  colicin V production protein  35.04 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2714  colicin V production protein  35.04 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.134664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2593  colicin V production protein  35.04 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.272788  normal  0.627447 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2605  colicin V production protein  35.04 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.685477 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1907  colicin V production protein  35.88 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02238  membrane protein required for colicin V production  31.29 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2469  colicin V production protein  31.29 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1339  colicin V production protein  31.29 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02198  hypothetical protein  31.29 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  28.08 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2464  colicin V production protein  31.29 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2607  colicin V production protein  31.29 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0685  CvpA family protein  38.83 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.345398  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2303  colicin V production protein  32.41 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0763  CvpA family protein  37.25 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1785  colicin V production protein  32.06 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.170102 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2301  CvpA family protein  37.25 
 
 		 164 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2862  colicin V production protein  31.29 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.488852  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1560  colicin V production protein  29.5 
 
 		 185 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.328677  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1715  CvpA family protein  36.89 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.235726  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1667  colicin V production protein  31.3 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1655  CvpA family protein  36.89 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.984666  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1864  CvpA family protein  36.89 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1373  colicin V production protein  31.29 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2439  CvpA family protein  36.89 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.267781  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0535  CvpA family protein  36.89 
 
 		 164 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1620  colicin V production protein  30.28 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3812  cvpA family protein  31.3 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3453  colicin V production protein  31.29 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03096  hypothetical protein  28.08 
 
 		 163 aa  52.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3329  colicin V production protein  34.26 
 
 		 166 aa  52.4  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2794  colicin V production protein  33.33 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2598  colicin V production protein  32.12 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402841  normal  0.0450921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4630  Colicin V production protein  31.71 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.202655  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  28.87 
 
 		 162 aa  52  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02505  colicin V production protein  28.82 
 
 		 248 aa  51.6  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.785902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1901  colicin V production protein  32.41 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1533  colicin V production protein  29.79 
 
 		 185 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1999  colicin V production protein  30.3 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.148494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3762  colicin V production protein  29.79 
 
 		 185 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2571  colicin V production protein  29.93 
 
 		 163 aa  51.2  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  30.22 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1398  colicin V production protein  32.41 
 
 		 162 aa  50.4  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2455  putative colicin V production protein, dedE  34.17 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1482  colicin V production protein  29.63 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.842254 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>