18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2184 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2184  putative carbohydrate kinase  100 
 
 
515 aa  1027    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6715  carbohydrate kinase FGGY  37.53 
 
 
459 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.877599 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5814  carbohydrate kinase FGGY  37.66 
 
 
459 aa  232  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2429  carbohydrate kinase  37.08 
 
 
461 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.850932  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0230  carbohydrate kinase FGGY  35.16 
 
 
463 aa  223  4.9999999999999996e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3565  carbohydrate kinase FGGY  37.76 
 
 
453 aa  219  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1051  carbohydrate kinase, FGGY  35.11 
 
 
475 aa  217  4e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6271  sugar kinase  37.62 
 
 
468 aa  216  7e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.918776  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2207  carbohydrate kinase FGGY  38.36 
 
 
483 aa  211  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.610278 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2599  carbohydrate kinase, FGGY  34.45 
 
 
456 aa  207  3e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2124  carbohydrate kinase, FGGY  34.51 
 
 
493 aa  207  4e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0277297  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3634  carbohydrate kinase FGGY  33.49 
 
 
482 aa  182  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206417  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3882  carbohydrate kinase FGGY  27.6 
 
 
467 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4893  carbohydrate kinase FGGY  26.3 
 
 
447 aa  123  7e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4213  carbohydrate kinase, FGGY  25.39 
 
 
453 aa  120  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212692  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1805  Sugar (pentulose and hexulose) kinase-like protein  28.66 
 
 
474 aa  110  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4923  carbohydrate kinase FGGY  27.96 
 
 
460 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3973  carbohydrate kinase FGGY  28.47 
 
 
479 aa  45.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0145215  normal  0.0173751 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>