21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1877 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1877  S1/P1 nuclease  100 
 
 		 307 aa  622  1e-177  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0607718 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2020  S1/P1 nuclease  57.49 
 
 		 287 aa  317  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02316  endonuclease  36.52 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3221  S1/P1 nuclease  35.87 
 
 		 272 aa  121  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0707943  normal  0.405467 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0491  S1/P1 nuclease  34.26 
 
 		 253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0943322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2128  hypothetical protein  31.21 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.491143  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2113  S1/P1 nuclease  31.06 
 
 		 299 aa  113  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.420885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00211  putative S1/P1 Nuclease  30.42 
 
 		 268 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07475  putative S1/P1 Nuclease  28.81 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0244  S1/P1 nuclease  29.47 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863137  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0551  S1/P1 nuclease  34.44 
 
 		 285 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.976409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0543  S1/P1 nuclease  27.24 
 
 		 266 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0162  S1/P1 nuclease  28.27 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02540  conserved hypothetical protein  33 
 
 		 393 aa  90.5  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1528  hypothetical protein  27.36 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1455  hypothetical protein  26.58 
 
 		 279 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9277  predicted protein  28.63 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.509446  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0027  hypothetical protein  25.45 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.512756 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5343  phospholipase C/P1 nuclease domain-containing protein  28.47 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.298135 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2279  hypothetical protein  42.05 
 
 		 127 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.523186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1908  hypothetical protein  39.66 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110697  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>