22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4856 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_4856  hypothetical protein  100 
 
 
261 aa  523  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4235  hypothetical protein  47.08 
 
 
239 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5405  hypothetical protein  43.35 
 
 
249 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5494  hypothetical protein  43.35 
 
 
249 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0743345  normal  0.20283 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5781  hypothetical protein  43.35 
 
 
249 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.448544  normal  0.0206259 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13951  hypothetical protein  44.58 
 
 
244 aa  186  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0836  hypothetical protein  42.37 
 
 
249 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.485389 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6070  hypothetical protein  42.08 
 
 
246 aa  181  7e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.790458  normal  0.16061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39700  acetyltransferase (GNAT) family protein  38.74 
 
 
207 aa  156  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7089  hypothetical protein  38.65 
 
 
210 aa  149  6e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.670641  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5404  hypothetical protein  39.67 
 
 
269 aa  148  7e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9378  hypothetical protein  37.76 
 
 
206 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.744975  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5100  hypothetical protein  36.89 
 
 
221 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.333  hitchhiker  0.000000366045 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3580  hypothetical protein  36.59 
 
 
205 aa  142  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4974  hypothetical protein  37.4 
 
 
205 aa  142  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4582  hypothetical protein  36.89 
 
 
218 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466428  hitchhiker  0.0015101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4539  hypothetical protein  37.3 
 
 
212 aa  140  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4505  hypothetical protein  38.98 
 
 
244 aa  136  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0109204 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7331  hypothetical protein  34.48 
 
 
212 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.268079 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2151  GCN5-related N-acetyltransferase  34.84 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4689  GCN5-related N-acetyltransferase  31.3 
 
 
224 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.969792  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6428  GCN5-related N-acetyltransferase  40.54 
 
 
204 aa  102  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>