34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3461 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3461  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  315  2e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.239912  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0847  hypothetical protein  36.46 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27251  hypothetical protein  29.55 
 
 		 126 aa  50.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0371  hypothetical protein  33.66 
 
 		 145 aa  50.8  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37992e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2433  hypothetical protein  34.41 
 
 		 120 aa  50.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0955395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4717  hypothetical protein  36.78 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.729727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2592  hypothetical protein  31.75 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000455117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0308  hypothetical protein  35.21 
 
 		 112 aa  48.9  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000160986  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2114  hypothetical protein  34.69 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.815328  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3594  hypothetical protein  35.19 
 
 		 136 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32654  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1885  hypothetical protein  37.89 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0572068  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1505  hypothetical protein  41.38 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5433  hypothetical protein  55.56 
 
 		 141 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00625909  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2011  hypothetical protein  46.55 
 
 		 124 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.837589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3104  hypothetical protein  39.47 
 
 		 137 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0650  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  45.1  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00148842  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3061  hypothetical protein  39.47 
 
 		 137 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130056  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3045  hypothetical protein  39.47 
 
 		 137 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2876  putative transmembrane protein  60 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000745882  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11632  hypothetical protein  31.67 
 
 		 132 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.079961 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1345  hypothetical protein  29.41 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.405691  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6425  hypothetical protein  36.71 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0231  hypothetical protein  27.91 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4966  hypothetical protein  24.42 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4344  hypothetical protein  50 
 
 		 137 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.272285  normal  0.232691 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0381  hypothetical protein  57.58 
 
 		 104 aa  42  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.88791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2821  hypothetical protein  42.86 
 
 		 137 aa  41.6  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.650851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3177  hypothetical protein  34.02 
 
 		 171 aa  41.6  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1387  hypothetical protein  27.73 
 
 		 200 aa  41.6  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2222  hypothetical protein  29.47 
 
 		 150 aa  41.2  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1449  hypothetical protein  40 
 
 		 162 aa  41.2  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3698  hypothetical protein  38.71 
 
 		 141 aa  40.8  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.309374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4195  hypothetical protein  44.74 
 
 		 137 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 113 aa  40.4  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000905882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>