18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3309 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3309  DivIVA domain protein  100 
 
 
148 aa  296  4e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1171  DivIVA domain protein  62.07 
 
 
106 aa  102  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2146  hypothetical protein  44.63 
 
 
126 aa  102  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00360758  hitchhiker  0.00871202 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06340  hypothetical protein  46.15 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2188  hypothetical protein  50 
 
 
121 aa  87.8  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.543165  normal  0.744038 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0779  hypothetical protein  54.26 
 
 
191 aa  87  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4507  hypothetical protein  46.23 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4004  hypothetical protein  63.49 
 
 
103 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0130375  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4234  hypothetical protein  63.49 
 
 
103 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.326138 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4078  hypothetical protein  63.49 
 
 
103 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.116498  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11233  hypothetical protein  50.62 
 
 
122 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.155825  normal  0.0761739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1095  DivIVA domain protein  40 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.423164  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3838  hypothetical protein  48.21 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0245433 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0650  hypothetical protein  40.79 
 
 
167 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192275  hitchhiker  0.00213419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0878  hypothetical protein  46.43 
 
 
206 aa  47.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7945  hypothetical protein  38.2 
 
 
185 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1202  hypothetical protein  32.89 
 
 
100 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19450  hypothetical protein  30.53 
 
 
99 aa  40.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.735309  normal  0.0185539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>