34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2269 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2269  DivIVA domain protein  100 
 
 
58 aa  120  5e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.462788  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27320  cell division initiation protein  68.29 
 
 
281 aa  65.5  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3009  DivIVA domain protein  72.5 
 
 
276 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3248  hypothetical protein  79.41 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3310  DivIVA family protein  79.41 
 
 
272 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.513657  decreased coverage  0.00703488 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3515  DivIVA family protein  70 
 
 
271 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.531582  normal  0.0704392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3259  DivIVA family protein  70 
 
 
272 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.22556  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2996  DivIVA family protein  68.29 
 
 
274 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.154546 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5755  DivIVA family protein  68.29 
 
 
273 aa  64.7  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12175  hypothetical protein  70 
 
 
260 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.58453 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3432  DivIVA family protein  69.05 
 
 
271 aa  62.8  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.608556  hitchhiker  0.00685853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3206  DivIVA family protein  69.05 
 
 
270 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.649811 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3254  DivIVA domain protein  67.5 
 
 
240 aa  62.4  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309743  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2638  DivIVA domain protein  67.5 
 
 
266 aa  61.6  0.000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167022  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3794  DivIVA family protein  67.5 
 
 
218 aa  56.6  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.527169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4004  DivIVA family protein  61.9 
 
 
254 aa  56.6  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.693665  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32400  DivIVA protein  56.76 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.472474  normal  0.56982 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0651  hypothetical protein  56.76 
 
 
631 aa  46.2  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5089  DivIVA family protein  56.1 
 
 
350 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  hitchhiker  0.000812567 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0782  hypothetical protein  47.5 
 
 
89 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1423  hypothetical protein  56.1 
 
 
316 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0313164  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6099  DivIVA family protein  52.38 
 
 
347 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.093 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0065  hypothetical protein  42.5 
 
 
89 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.261893 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3723  DivIVA family protein  54.55 
 
 
168 aa  40.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0113973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3910  cell-division initiation protein DivIVA  54.55 
 
 
168 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000004632 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1244  cell-division initiation protein DivIVA  54.55 
 
 
168 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00035282  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3997  cell-division initiation protein DivIVA  54.55 
 
 
168 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000765198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3948  cell-division initiation protein DivIVA  54.55 
 
 
168 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402418  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1888  DivIVA family protein  46.51 
 
 
161 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000234515  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3941  cell-division initiation protein DivIVA  54.55 
 
 
168 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.174624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4035  cell-division initiation protein DivIVA  54.55 
 
 
168 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0113454  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3655  cell-division initiation protein (DivIVA)  54.55 
 
 
168 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3638  cell-division initiation protein (DivIVA)  54.55 
 
 
168 aa  40.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0761533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3747  cell-division initiation protein DivIVA  54.55 
 
 
168 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>