11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1471 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0739  FHA domain-containing protein  62.26 
 
 
580 aa  654    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002863 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1399  hypothetical protein  67.72 
 
 
548 aa  746    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.017584  normal  0.241063 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1471  hypothetical protein  100 
 
 
574 aa  1163    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.11734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5901  FHA domain-containing protein  61.24 
 
 
511 aa  648    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0502803  normal  0.176709 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0821  FHA domain-containing protein  39.96 
 
 
652 aa  374  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000484156  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2611  FHA domain-containing protein  37.78 
 
 
632 aa  347  3e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.638236  normal  0.0395029 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1608  FHA domain-containing protein  38.57 
 
 
668 aa  324  3e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.861318 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4210  collagen adhesion protein  37.5 
 
 
2179 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.950826  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  37.93 
 
 
2914 aa  47.4  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1095  collagen adhesion protein  36.76 
 
 
2272 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  56.25 
 
 
1049 aa  43.9  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0821611 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>