22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0229 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0229  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  200  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00650925  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3597  hypothetical protein  99.03 
 
 		 103 aa  198  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0220403  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4937  hypothetical protein  46.32 
 
 		 100 aa  84.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0942903  normal  0.32552 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2300  hypothetical protein  40.43 
 
 		 103 aa  80.5  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1096  hypothetical protein  42.11 
 
 		 100 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1746  hypothetical protein  43.16 
 
 		 100 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0623584  normal  0.256502 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1052  hypothetical protein  48.89 
 
 		 99 aa  78.2  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00452566  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1179  hypothetical protein  52.63 
 
 		 100 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.933496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5651  hypothetical protein  51.58 
 
 		 100 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1983  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490297 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0965  hypothetical protein  50 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00474357 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5400  hypothetical protein  38.54 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4717  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.18 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.649718 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4010  hypothetical protein  40.54 
 
 		 239 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.927237  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0915  hypothetical protein  44.21 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4025  hypothetical protein  41.76 
 
 		 99 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.373255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4409  hypothetical protein  36.46 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.5782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1383  hypothetical protein  31.58 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1950  hypothetical protein  37.35 
 
 		 219 aa  53.9  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1939  hypothetical protein  37.35 
 
 		 219 aa  53.9  0.0000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  38.89 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.07 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>