28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1818 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1818  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 267 aa  553  1e-156  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2432  TatD-related deoxyribonuclease  95.51 
 
 		 267 aa  531  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0988  TatD-related deoxyribonuclease  56.44 
 
 		 271 aa  324  1e-87  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.981061 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2472  TatD-related deoxyribonuclease  56.06 
 
 		 277 aa  319  3e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.847165  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1555  TatD-related deoxyribonuclease  55.94 
 
 		 277 aa  314  8e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2285  TatD-related deoxyribonuclease  46.25 
 
 		 307 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2328  TatD-related deoxyribonuclease  41.73 
 
 		 291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0111836  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0159  TatD-related deoxyribonuclease  42.11 
 
 		 310 aa  216  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0719337  hitchhiker  0.00000000000886366 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2882  TatD-related deoxyribonuclease  41.76 
 
 		 342 aa  214  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0430  TatD-related deoxyribonuclease  41.06 
 
 		 328 aa  211  9e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.340827  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0778  TatD-related deoxyribonuclease  42.26 
 
 		 266 aa  209  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11120  predicted metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold protein  39.1 
 
 		 287 aa  208  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7264  TatD-related deoxyribonuclease  42.92 
 
 		 328 aa  208  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00204117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0991  TatD-related deoxyribonuclease  41.25 
 
 		 380 aa  202  3e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1549  TatD-related deoxyribonuclease  42.8 
 
 		 303 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450153  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0197  TatD-related deoxyribonuclease  25 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00720719  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1205  TatD-related deoxyribonuclease  28.96 
 
 		 253 aa  90.1  3e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1429  TatD-related deoxyribonuclease  28.19 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.123471  normal  0.114014 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0479  TatD-related deoxyribonuclease  28.63 
 
 		 253 aa  87  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.671319  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1417  TatD-related deoxyribonuclease  25.77 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0537  TatD-related deoxyribonuclease  25.97 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4063  TatD-related deoxyribonuclease  29.29 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4096  TatD-related deoxyribonuclease  28.87 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000024322  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0961  TatD-related deoxyribonuclease  26.36 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1220  TatD-related deoxyribonuclease  25.19 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3953  TatD-related deoxyribonuclease  31.28 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0471  TatD-related deoxyribonuclease  32.18 
 
 		 274 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424562  normal  0.608215 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2017  TatD-related deoxyribonuclease  23.48 
 
 		 253 aa  68.9  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>