33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0142 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0125  hypothetical protein  95.38 
 
 		 541 aa  1055    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0142  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1109    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29120  hypothetical protein  37.78 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00446947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3985  hypothetical protein  35.96 
 
 		 361 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.315148  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5355  hypothetical protein  29.58 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1789  hypothetical protein  32.58 
 
 		 364 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.651057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1412  hypothetical protein  32.07 
 
 		 358 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1582  hypothetical protein  33.33 
 
 		 355 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422595  normal  0.277534 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3903  hypothetical protein  33.33 
 
 		 356 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4093  hypothetical protein  38.93 
 
 		 357 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4572  hypothetical protein  38.17 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1317  hypothetical protein  38.17 
 
 		 357 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.828005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3749  hypothetical protein  33.49 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2262  hypothetical protein  30.85 
 
 		 413 aa  104  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.279668  normal  0.10352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03982  hypothetical protein  33.13 
 
 		 369 aa  103  7e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.47471  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3872  hypothetical protein  38.17 
 
 		 357 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.286953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1600  hypothetical protein  32.95 
 
 		 357 aa  101  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.867208  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0193  hypothetical protein  32.7 
 
 		 397 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4190  hypothetical protein  32.5 
 
 		 395 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0375  hypothetical protein  36.84 
 
 		 382 aa  95.1  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4139  hypothetical protein  23.29 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12788  hypothetical protein  26.46 
 
 		 401 aa  77  0.0000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.405764  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0521  AsmA  26.48 
 
 		 789 aa  52  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2083  hypothetical protein  22.27 
 
 		 385 aa  51.2  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1873  hypothetical protein  22.27 
 
 		 385 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2712  hypothetical protein  21.6 
 
 		 595 aa  48.5  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1794  hypothetical protein  21.96 
 
 		 385 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.400536  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2829  hypothetical protein  22 
 
 		 1200 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.832798  hitchhiker  0.000000897971 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2796  hypothetical protein  19.23 
 
 		 1069 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2416  hypothetical protein  19.95 
 
 		 1072 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.845474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1745  hypothetical protein  22.54 
 
 		 384 aa  44.3  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.886322  normal  0.285515 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2486  hypothetical protein  19.31 
 
 		 1067 aa  44.3  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0828259  normal  0.280975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00932  hypothetical protein  22.09 
 
 		 1156 aa  43.9  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.697292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>