45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3219 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_3219  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  660    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1480  hypothetical protein  46.63 
 
 
232 aa  173  5e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213383  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2468  hypothetical protein  41.18 
 
 
281 aa  170  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1318  hypothetical protein  44.08 
 
 
227 aa  170  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.000000517485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4288  hypothetical protein  43.5 
 
 
282 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2907  hypothetical protein  45.68 
 
 
434 aa  145  6e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  45.06 
 
 
434 aa  144  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0597  hypothetical protein  34.36 
 
 
218 aa  105  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 
402 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36844  predicted protein  33.53 
 
 
382 aa  99  9e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1527  hypothetical protein  31.61 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2516  methyltransferase  30 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.524649  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2025  hypothetical protein  32.64 
 
 
236 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1603  methyltransferase  31.52 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0961948  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5468  hypothetical protein  29.01 
 
 
252 aa  58.9  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2763  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  25.13 
 
 
222 aa  58.5  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.076486  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14461  hypothetical protein  34.21 
 
 
241 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1531  hypothetical protein  29.27 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.842491  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3940  macrocin-O-methyltransferase  27.07 
 
 
301 aa  55.5  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.881995  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4223  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  26.24 
 
 
273 aa  53.5  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3453  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  25.88 
 
 
485 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4841  hypothetical protein  28.26 
 
 
268 aa  52.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2056  hypothetical protein  28.05 
 
 
257 aa  50.1  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2171  hypothetical protein  29.33 
 
 
213 aa  49.7  0.00007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3930  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.66 
 
 
236 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0248  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  27.11 
 
 
276 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.323725  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3035  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  27.03 
 
 
882 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.608951  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4080  macrocin O-methyltransferase  25.53 
 
 
281 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.310855  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1328  bacteriocin O-metyltransferase, putative  26.24 
 
 
281 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0742  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  25.14 
 
 
251 aa  45.4  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1831  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1109  O-methyltransferase  26.24 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1103  O-methyltransferase  26.24 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1291  macrocin-O-methyltransferase  24.4 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1290  putative bacteriocin O-metyltransferase  26.24 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.133264 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1366  putative bacteriocin O-metyltransferase  26.24 
 
 
281 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1261  macrocin O-methyltransferase  24.82 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0698  hypothetical protein  28.42 
 
 
227 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.658114  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1203  putative methyltransferase  24.87 
 
 
266 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139767  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0930  macrocin-O-methyltransferase  24.1 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3359  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.53 
 
 
246 aa  44.3  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13053  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3746  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  22.71 
 
 
240 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.521801 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1116  macrocin-O-methyltransferase  24.48 
 
 
281 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2046  hypothetical protein  25.13 
 
 
257 aa  43.1  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15378  hitchhiker  0.00220889 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2577  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  21.26 
 
 
268 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000150088  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>