54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2909 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2909  cytochrome bd-type ubiquinol oxidase subunit II  100 
 
 		 342 aa  677    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0553  cytochrome bd-type ubiquinol oxidase subunit II  82.14 
 
 		 337 aa  502  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1169  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  50.6 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.171142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1147  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 2-like protein  50.6 
 
 		 339 aa  280  3e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0673  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  49.25 
 
 		 338 aa  264  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4918  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.63 
 
 		 341 aa  192  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3761  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  35.03 
 
 		 341 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5339  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II, putative  36.09 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5016  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.12 
 
 		 341 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4906  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.12 
 
 		 341 aa  189  8e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5314  putative cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.12 
 
 		 341 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.8662400000000005e-24 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5614  putative cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.61 
 
 		 341 aa  188  9e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000139599 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5461  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  35.12 
 
 		 341 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5074  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  35.12 
 
 		 341 aa  189  9e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5396  putative cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  35.12 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0578  cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2  37.39 
 
 		 343 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5345  putative cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  34.72 
 
 		 341 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2681  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II-related protein  31.5 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000218103  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4082  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II-related protein  30.04 
 
 		 288 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1158  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II-related protein  30.04 
 
 		 288 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4099  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II-related protein  29.3 
 
 		 288 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000497736  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3994  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II-related protein  29.82 
 
 		 288 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4192  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II-related protein  29.82 
 
 		 288 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3737  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II-like protein  29.82 
 
 		 288 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3721  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II-like protein  29.82 
 
 		 288 aa  90.9  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3889  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II-related protein  29.82 
 
 		 288 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.52537  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3806  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II-like protein  30.8 
 
 		 288 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.155775  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4028  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II-related protein  28.94 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.955139  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1111  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  25.54 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6579  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  26.57 
 
 		 330 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2244  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  26.54 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.171072  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0940  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  26.18 
 
 		 338 aa  67  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.528842  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7913  terminal oxidase subunit II  25.23 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1001  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  25.54 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0998  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  24.62 
 
 		 338 aa  62.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2017  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  22.26 
 
 		 347 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0257  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  32.99 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.794868 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5725  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  22.78 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2613  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  20.17 
 
 		 339 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.251199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2202  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  22.47 
 
 		 349 aa  50.4  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000104234 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3839  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  22.32 
 
 		 335 aa  50.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.425133  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2687  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  22.26 
 
 		 345 aa  49.7  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0982  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  25.24 
 
 		 351 aa  49.3  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00231711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3724  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 2- like protein  25.55 
 
 		 424 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.77992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1394  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  20.97 
 
 		 339 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0429181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1267  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  22.33 
 
 		 334 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.690113 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3857  hypothetical protein  24.84 
 
 		 335 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.346842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1766  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  24.92 
 
 		 343 aa  46.6  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5646  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  22.45 
 
 		 341 aa  45.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4671  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  23.9 
 
 		 334 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.297118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3131  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  22.56 
 
 		 336 aa  43.1  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.305422 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6969  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  22.43 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6191  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  22.32 
 
 		 335 aa  43.1  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1694  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  21.7 
 
 		 345 aa  43.1  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179365 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>