39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_1614 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1615  protein of unknown function UPF0236  100 
 
 
1368 bp  2712    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0133469  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1614    100 
 
 
3781 bp  7495    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0231261  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1481  protein of unknown function UPF0236  99.42 
 
 
1368 bp  2648    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1419  protein of unknown function UPF0236  99.85 
 
 
1368 bp  2696    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000631859  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1252  protein of unknown function UPF0236  99.42 
 
 
1368 bp  2648    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.578671  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1055  protein of unknown function UPF0236  99.42 
 
 
1368 bp  2648    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000029842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0500  protein of unknown function UPF0236  99.93 
 
 
1368 bp  2704    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0249  protein of unknown function UPF0236  99.42 
 
 
1368 bp  2648    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3360  protein of unknown function UPF0236  100 
 
 
1368 bp  2712    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000531623  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3498  protein of unknown function UPF0236  94.23 
 
 
1365 bp  2081    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2943    94.01 
 
 
1363 bp  2052    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1112    93.52 
 
 
1312 bp  1915    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0331    94.3 
 
 
1364 bp  2077    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1829  protein of unknown function UPF0236  79.62 
 
 
1377 bp  305  5e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000497336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0875  protein of unknown function UPF0236  79.5 
 
 
1368 bp  297  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1931  protein of unknown function UPF0236  79.26 
 
 
1368 bp  281  7e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1382    79.26 
 
 
1367 bp  281  7e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0726    79.26 
 
 
1367 bp  281  7e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00383666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0725    79.26 
 
 
4288 bp  281  7e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0261  hypothetical protein  81.71 
 
 
2136 bp  87.7  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0449    86.02 
 
 
408 bp  81.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0787  protein of unknown function DUF255  81.88 
 
 
2061 bp  81.8  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1054  calcium-translocating P-type ATPase, PMCA-type  100 
 
 
2694 bp  75.8  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00407371  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0291  hypothetical protein  84.04 
 
 
2043 bp  67.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2990  hypothetical protein  90.74 
 
 
2091 bp  67.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.901065  hitchhiker  0.00330931 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0998  hypothetical protein  90.38 
 
 
2118 bp  63.9  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1679  hypothetical protein  90.38 
 
 
2283 bp  63.9  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.637291  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6036  hypothetical protein  92.68 
 
 
1791 bp  58  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1902  protein of unknown function DUF255  85.94 
 
 
2034 bp  56  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1315  hypothetical protein  89.36 
 
 
2064 bp  54  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.529434  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2409  hypothetical protein  94.29 
 
 
2232 bp  54  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.260211  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1460  hypothetical protein  81.55 
 
 
2163 bp  54  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1140  protein of unknown function DUF255  81.91 
 
 
2214 bp  52  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1270  hypothetical protein  90.48 
 
 
2031 bp  52  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.809248 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1263  hypothetical protein  92.11 
 
 
2037 bp  52  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.890044  normal  0.167783 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0107  hypothetical protein  87.04 
 
 
2049 bp  52  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.926575  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0543  hypothetical protein  92.11 
 
 
2112 bp  52  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2330  protein of unknown function DUF255  86.79 
 
 
2082 bp  50.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00802642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1111  protein of unknown function DUF255  85.25 
 
 
2100 bp  50.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.992934  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>