21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3318 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_0138  hypothetical protein  76.13 
 
 
469 aa  702    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000720067  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3318  hypothetical protein  100 
 
 
467 aa  954    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1514  hypothetical protein  45.22 
 
 
476 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.721483  normal  0.922529 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2788  hypothetical protein  48.32 
 
 
484 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0973  hypothetical protein  44.66 
 
 
485 aa  370  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.442051  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1763  hypothetical protein  40.55 
 
 
501 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1912  hypothetical protein  41.65 
 
 
484 aa  357  2.9999999999999997e-97  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398652  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2733  hypothetical protein  38.41 
 
 
478 aa  356  5e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1929  hypothetical protein  40.53 
 
 
510 aa  345  7e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.696713  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3680  hypothetical protein  39.16 
 
 
506 aa  325  1e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0011  hypothetical protein  35.68 
 
 
493 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0676  hypothetical protein  36.06 
 
 
454 aa  263  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2690  hypothetical protein  34.89 
 
 
498 aa  253  5.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2711  hypothetical protein  35.07 
 
 
474 aa  237  4e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2583  hypothetical protein  29.86 
 
 
463 aa  171  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0198931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1062  hypothetical protein  27 
 
 
460 aa  120  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2689  hypothetical protein  27.74 
 
 
506 aa  109  1e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2710  hypothetical protein  27.05 
 
 
519 aa  108  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0677  hypothetical protein  28.96 
 
 
524 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.823751 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0471  hypothetical protein  25.76 
 
 
373 aa  91.3  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1101  hypothetical protein  33.82 
 
 
688 aa  46.6  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>