14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0568 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0568  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  254  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0168206  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1104  hypothetical protein  46.88 
 
 		 147 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000403669  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0290  hypothetical protein  41.67 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0022  hypothetical protein  35.16 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0432  hypothetical protein  34.68 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0682  hypothetical protein  51.82 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.798662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2727  hypothetical protein  35.29 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.194095 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3050  hypothetical protein  38.21 
 
 		 127 aa  66.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3072  hypothetical protein  38.21 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.283945  normal  0.874986 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1877  hypothetical protein  38.02 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1628  hypothetical protein  32.56 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0522  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  44.7  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.62682  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1202  hypothetical protein  38.74 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.00000000142447  hitchhiker  0.00000387981 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0445  hypothetical protein  28.8 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>