26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1663 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  100 
 
 		 246 aa  504  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  46.41 
 
 		 254 aa  223  2e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  44.96 
 
 		 251 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0106  hypothetical protein  37.13 
 
 		 240 aa  162  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  38.49 
 
 		 242 aa  158  9e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  38.08 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  37.86 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.74 
 
 		 243 aa  128  9.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1800  capsular polysaccharide biosynthesis protein  30.93 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.6322  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  33.2 
 
 		 494 aa  107  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  31.84 
 
 		 504 aa  104  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  26.61 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  28.4 
 
 		 241 aa  96.3  4e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  26.21 
 
 		 245 aa  93.2  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  28.98 
 
 		 253 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  29.55 
 
 		 253 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  26.01 
 
 		 246 aa  72  0.000000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  23.08 
 
 		 241 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  27.27 
 
 		 258 aa  68.9  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  22.41 
 
 		 240 aa  68.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  22.88 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  26.95 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  25.1 
 
 		 529 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  25.47 
 
 		 240 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  25.45 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  20.63 
 
 		 548 aa  50.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0665457 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>