11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1262 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1262  rhodanese domain protein  100 
 
 		 141 aa  290  5e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2963  Rhodanese domain protein  93.57 
 
 		 140 aa  276  7e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2518  hypothetical protein  60.18 
 
 		 140 aa  150  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.956557  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1977  Rhodanese domain protein  45.52 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.474064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3866  Rhodanese domain protein  34.21 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.138224  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3122  rhodanese-like protein  24.03 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  23.66 
 
 		 711 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1960  rhodanese-like protein  29.55 
 
 		 155 aa  42  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000451081  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  26.67 
 
 		 397 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0025  Rhodanese domain protein  27.62 
 
 		 157 aa  40.4  0.009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000045135  normal  0.0554367 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4224  rhodanese domain-containing protein  25.37 
 
 		 125 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>